Vladimir Poroikov » Publication

Share It:
Blog It:
Published 2013-07-19 Published on SciPeople2013-10-19 10:36:33 JournalХимико-фармацевтический журнал


Виртуальный скрининг в библиотеках коммерчески доступных органических соединений потенциальных средств для профилактики ВИЧ-инфекции
Лагунин А.А., Филимонов Д.А., Глориозова Т.А., Тарасова О.А., Zakharov A.V., Guash-Pamies L., Nicklaus M.C., Поройков В.В. / Vladimir Poroikov
Химико-фармацевтический журнал, 2013, 47 (7) 3-21.
Abstract Поиск новых средств для лечения и профилактики ВИЧ/СПИД остается актуальным, несмотря на достижения высокоактивной антиретровирусной терапии (ВААРТ), как из-за возникновения резистентности к существующим препаратам, так и из-за присущих им побочных эффектов и токсичности. Эффективная химиопрофилактика может быть достигнута путем применения препаратов, которые блокируют жизненный цикл вируса до того, как вирус интегрируется в геном человека. Поэтому преимуществами обладают два широко используемых класса препаратов – ненуклеозидные ингибиторы обратной транскриптазы (RT) и ингибиторы реакции переноса цепи интегразой (IN). Кроме того, в качестве перспективных мишеней могут рассматриваться такие белки, как CD4, gp120, CCR5, CXCR4 и gp41, так как установлена их функциональная роль на ранних стадиях взаимодействия вириона с клеткой хозяина. Поскольку к настоящему моменту установлено, что все разрешенные к медицинскому применению антиретровирусные препараты вызывают возникновение резистентных штаммов вируса, новые анти-ВИЧ вещества должны иметь существенные отличия по химической структуре от известных лекарств, а также (по возможности) воздействовать на несколько фармакологических мишеней. Поиск такого рода «кандидатов» может быть выполнен методами виртуального скрининга в библиотеках коммерчески доступных образцов химических соединений, которые в настоящее время содержат десятки миллионов структурных формул уже синтезированных и доступных для биологического тестирования веществ. Виртуальный скрининг может быть реализован путем применения компьютерных программ PASS и PharmaExpert, что позволяет отобрать вещества, перспективные для экспериментальных исследований с учетом ряда прогностических критериев (наличие требуемых видов активности, отсутствие побочных и токсических эффектов, необходимые физико-химические характеристики). В работе представлены: современное состояние поиска новых препаратов для терапии и профилактики ВИЧ/СПИД, разработанный нами подход к виртуальному скринингу новых потенциальных средств для профилактики ВИЧ/СПИД, и результаты ее применения к базам данных доступных для скрининга химических соединений. Проанализированы возможности выявления анти-ВИЧ препаратов, действующих на несколько фармакологических мишеней, среди уже синтезированных веществ. Сделан вывод о перспективности рационального дизайна таких лекарств путем применения методов компьютерного конструирования лекарств.

No comments

You should sign in or sign up for comment this post